January 01, 2013

New Year's Resolution

听说New year's resolution要在零点前写完否则不灵……

正经地说:Be brave, be patient, be confident.

实际地说:考试顺利,实验顺利,paper顺利…

蛋疼地说:要不给我个妹纸吧!

December 04, 2012

概率图模型学习笔记 - 概率的解释I 经典概率

要讨论概率图模型,得先从概率的定义和解释说起。朴素地说,概率是描述一个事件发生可能性大小的量度。

  数学上来说,概率论所研究的概率空间并不是什么新奇的玩意(如果我没记错的话,大学概率老师上课的时候说过,因为概率空间太无聊了,所以数学家们都对概率论没什么兴趣)。朴素的理解不需要了解概率空间的理论细节,反正没什么特别的。

  我们将所有感兴趣的事件放在一起构成一个集合,叫事件空间,然后给这里头每个事件分配一个0到1之间的实数,认为这个数就是这个事件发生的可能性大小,叫这个事件的概率。对于分配的实数,我们只有一个要求,就是事件空间内的所有概率之和等于1。

  OK,现在我们成功地用一个0到1......

December 02, 2012

概率图模型学习笔记I - 引子

我是个有CS背景的医学生,并不是工科的人。我突发奇想要开始学概率图模型是因为Coursera上有这样一节课,然后我之前知道自然语言处理之中使用的HMM模型就是一种无向图模型。我对自然语言处理很感兴趣,于是对概率图模型(Probabilistic Graphic Model)产生了好奇心。

我下定决心要好好学习概率图模型是因为在PubMed上看iPS细胞(今年诺贝尔医学奖)相关的文章时,偶然在Cell上发现了这么一篇神奇的文献:

Single-Cell Expression Analyses during Cellular Reprogramming Reveal an Early Sto......